医学情報処理演習2007年度

日程変更！！

2008年1月14日に第12回「一般化線型モデル」を実施予定にしていましたが，14日は国民の祝日でしたので，1月7日に変えます。よろしくお願いします。

キーワード

データ解析，データの水準，帰無仮説，検定，推定，信頼区間

授業の目標および期待される学習効果

（目標）: 統計ソフトウェアを使った実際のデータ解析を通して，医学統計学の講義で学んだ統計手法を，よりしっかりと身に付ける
（学習効果）: 実験データや調査データを適切に分析できる能力を身につけることが期待される

授業の概要

実験計画や調査デザインに適したデータ構造の設計を行い，表計算ソフトで入力したデータを統計処理ソフトで適切な手法を用いて解析し，その結果を解釈する，という一連の流れを，さまざまな種類のデータについて繰り返し実践する。講義と演習を情報処理演習室で行う。

授業内容のレベル

教養教育でコンピュータ操作の基礎は身に付いているはずであり，前期に「医学統計学」で統計学の基礎は理解しているはずなので，実際の統計処理を実践することを主眼におく。

履修資格

医学部医学科２年生（「医学統計学」履修を前提とする）

テキスト／参考書

データ及び課題を掲載した講義資料を配布する（12月25日，中澤　港(2007)『Rによる保健医療データ解析演習』ピアソン・エデュケーション，税込み2,940円として出版予定。講義開始に間に合わなかったので，少なくとも出版までは配布する）。統計ソフトウェアとしてはフリーソフトのRを使用するので，以下のテキストが参考になるであろう。

中澤　港(2003)『Rによる統計解析の基礎』（ピアソン・エデュケーション）1,800円
間瀬茂・神保雅一・鎌倉稔成・金藤浩司(2004)『工学のための数学３　工学のためのデータサイエンス入門 ― フリーな統計環境Rを用いたデータ解析 ― 』（数理工学社）2,300円
岡田昌史（編）(2004)『The R Book －データ解析環境Rの活用事例集－』（九天社）
舟尾暢男 (2005) 『The R tips －データ解析環境Rの基本技・グラフィックス活用集』（九天社）
U.リゲス（著），石田基広（訳）『Rの基礎とプログラミング技法』（シュプリンガー）
P.Dalgaard（著），岡田昌史（監訳）『Rによる医療統計学』（丸善）

また，以下のウェブサイトが参考になるであろう。

Rによる統計処理（本学社会情報学部・青木繁伸教授による）
RjpWiki（筑波大学の岡田さんが管理されている，日本におけるRユーザコミュニティの代表的なサイト）

授業の形式

臨床研究棟演習室のコンピュータを使って，サンプルデータを分析してみる。

評価

毎回，課題の回答を提出することとし，その結果によって評価する。期末試験は実施しない。出席状況に不安がある者は，最終講義日の1月21日までに追加レポートを提出すること（テーマはデータ処理に関することなら何でも良い）。

メッセージ

統計は，実際にデータを扱って初めてわかってくるものです。慣れるまでは大変かもしれませんが，やっているうちにわかってくると思います。

オフィスアワー

月曜～金曜・10:30～12:00，電子メール：nminato@med.gunma-u.ac.jp

授業の展開

データ入力（10月1日4-6時限）：課題データMS-Excel形式
基本的な図示（10月15日4-6時限）：ESRIジャパンの日本地図データサイト | 群馬県市町村別65歳以上人口割合データ | 塗り分け地図を画面に表示するためのRコード（日本地図データを作業ディレクトリに展開し，群馬県データを作業ディレクトリにコピーした状態で実行する） | 精子数データ | 精子数と年次の散布図を描くRコード（精子数データを作業ディレクトリにコピーして実行する） | 課題用データ
記述統計量（10月22日4-6時限）：前回の解答例と今回の課題
標本統計量と母数推定（10月29日4-6時限）：前回の解答例と今回の課題
データの分布と検定の概念（11月5日4-6時限）：前回の解答例と今回の課題
２群の平均値の差の検定（11月12日4-6時限）：前回の解答例と今回の課題，課題用Rコード，課題解答例Rコード
一元配置分散分析と多重比較（11月19日4-6時限）：前回の解答例と今回の課題，今回の課題に必要なデータ，課題解答例Rコード
相関と回帰（11月26日4-6時限）：前回の解答例と今回の課題，課題用データ，課題解答例Rコード，課題解答例
計数データと比率の解析（12月3日4-6時限）：今回の課題 | 課題解答例Rコード
クロス集計（12月10日4-6時限）：前回の解答例と今回の課題 | 課題解答例
量的データのノンパラメトリックな分析法（12月17日4-6時限）：今回の課題 | 今回の課題に必要なデータ（第7回と共通） | 解答例 | 解答例のRコード
一般化線形モデル（1月7日4-6時限）：今回の課題| 解答例 | 解答例のRコード
生存時間解析（1月21日4-6時限）：今回の課題| 課題参考コード | 解答例 | 解答例のRコード

リンクと引用について