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保健学共通特講IV, VIII
Latest update: 6 August 2019 (Tue)
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講義の目標
保健学領域の研究を実施するための能力として,研究デザインと統計解析の基礎知識を教授する。
原則として講義は日本語で行う。留学生は必要に応じて講師に個別相談すること。
テキスト(日本語pdf,2019年7月24日版が最新)を適宜参照されたい(コメント歓迎)。自由にお使いいただきたい。
講義計画
本講義は,毎週水曜6限に,保健学研究科D101で実施します。
ただし,6月12日,7月10日は講義がありませんのでご注意ください。また,非常勤講師の徳原先生が担当される講義は7/27(土)の3限と4限に行います。
- 保健学研究の基礎(4月10日,資料)
- 保健学/疫学研究の指標とデザインの基礎知識(4月17日,プレゼン資料, 計算練習:事情により欠席する場合は,自力で計算練習に回答してメール添付で提出してください)(追記:講義中に触れた,800人以上の研究者から統計的有意性への反対意見が上がったことを伝えるNature記事)計算練習解答例
- サンプルサイズにまつわる問題(4月24日, 英語版資料→日本語が読める方はテキストをご覧ください)ICRwebのe-learning講座は参考になる。
- 研究のデザイン(5月8日, 資料)
- データ入力,欠損値処理,図示(5月15日, Excel format sample data)
- 仮説検定,標準偏差と標準誤差,分布の位置の差の検定(5月22日)
- 比率の差の検定,クロス集計表とその分析(5月29日英語版資料)
- 分散分析と多重比較(6月5日,英語版資料)
- 相関分析,回帰分析とその応用:共分散分析,ロジスティック回帰分析(6月19日, 英語版配付資料)
- 地理情報データ解析と空間疫学(谷村晋先生,6月26日)
- 反復測定:3群以上の間の対応のあるデータについての位置母数の比較;カッパ係数,マクネマーの検定(7月3日, 英語版資料,Bhapkarの検定のテストコード)
- 検査性能の評価:ROC,Bland-Altmanプロットとメタアナリシス入門(7月17日,ROCとBland-Altmanプロット資料,メタアナリシス資料)
メタアナリシスの例:全世界で精子数が減少しているか? という問題:
- 生存時間解析(参照,英語版handout)(7月24日)
- 実験データの解析(徳原先生,7月27日(土)13:10~16:20)
- ミニテスト(7月31日,受験できない場合は事前に連絡すること)(問題と解答例)
評価
ミニレポートとミニテストの結果により総合的に判定する。
参考文献・webサイトなど
- Machin D, Campbell MJ, Walters SJ (2007) Medical Statistics, 4th ed., Wiley
- Lang TA, Secic M (2006) How to report statistics in medicine: Annotated guidelines for authors, editors, and reviewers. 2nd ed., American College of Physicians.
- Peacock JL, Peacock PJ (2011) Oxford handbook of medical statistics. Oxford Univ. Press
- Power and Sample Size (Vanderbilt University)
- EZR (Jichi Medical School)
- 神田善伸 (2012) EZRでやさしく学ぶ統計学:EBMの実践から臨床研究まで. 中外医学社, ISBN:978-4-498-10900-1.
- d族効果量を計算するためのコード:dfamefs.R
- PearsonのデータでZ変換を使って相関係数の重み付き平均を出すコード:pooledr.R
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